У меня шумела МКПП, но вибрации не было. Шумели игольчатые подшипники первичного вала. Я тоже на диф думал, а его части нереально стоят. Пронесло. Гранаты тоже умирали, но вибрации тоже при этом не было, просто шарики повыпадывали и встал на месте))).
Тоже за вскрытие КПП. Диагностика ничего не покажет, короб никак не диагностируется.
Да, с тормозами все ок? Суппорта не заклинили, зазор между дисками и колодками есть?